Search for RNA polymerase II promoters (TSSs) in plant DNA sequences
Paste nucleotide sequence here: >Examle ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA TATATATATTTTAGATTTGCAATTAGGTTTTATTGCAATTTTATTAATTATATTCCTCCAAATCTTCCA TGATCTTTTTTTTTTCAATTTCAATTTTCAAAAGATAACATAGTTTAGTTTGTTGACTTTAAATTTGAA CATATTTTTCTTTTTCTGTTAGGAACTAAATATTTCATTATTTGCTTTTGACTTTTATGTTCGACTCAT CATCATCAATAATATCTTTAGATATTTATGCATATTAATAATATGATAAACTCTCACTTTTTTCCATTA TTTGTTACCGACTTTTTTTATTATCGTGTTTCTTTTTATTTTACTGATTTTAATATGTTTTACTATTGA GTCGAGGGTCTATATCGAAAATTACCTCTCTATCTTCAAAACGTAAGTATAAGATTGCGTGTACACCAC ACTCCTTATACCCTATTCGTGAAATCACACTGAATATATATGTATTATTGTTATCAAACTCTTATTATT AGCTAAAACGCGTAAATAAAGGGTAGCTAATCAAAGTTCATGTACTTTAAAAAAGGTTCAATTAGATTA ATAATTAACAATGTTTGTTTAGTTTAATTAAACCTAGTTGGCTTAGTTTAATCTCTTAATTAATTTATT TATTAATTAACTAATAATAACTATTGTTAGAAGATTGTTTTGTTGACTTGTTAACTATGCCCATGGGCC ATGGTCAACTTCAAAATAGATGTGTTGTGTTTGACTCTATAGACTTAAAATTAGGTTTTATAGGGTTGA AATTTAACCTAAGATCACTACAAAGAAAAAAATATATATAAATAAATAAAATGAGGACATTGAAAATTA AGAAATGTTAAAGTGGGCTAAGGTTGTTTTTTTTCAATTGAATAATTATATCATGAATTTTTAAATGTA TACTGGTGGTACAAGTTGATTATAGAATAATAAGGTTCAAGAAAATTTAATAAGTGATGTTAAAATTCG AATAAAATAAATTTATAAATACCTCAAAAGAAGTATAATTAATCGAGAGAACCTCAAATTGACGTAACA TAAAATGAAAAAGTCTTTTTGTAACTAATTATTCATAATAGTAAATAAATTATATTCATCTTTGATTAA TTTACCGACTGAAATTGATAAATATTTTGACTAAGAATATATAGTTGATAAATTAATTATTTGTAGCCG TAAAGTGATATGTATGTAGGAGGAGAAGCATTATTAGATTAAAATTAGAAAAAATGTCATTATATTTGC ACTAATGAATAGTATAATTAATCTTGTTGGTGCTTTTGGTAACAAATATAAAAATAAAATAAATAAAAT GGAATGTTCCTGTTTGAACATTATTTATTTTAATTAATTTAATTTAATATATTGTTGAAAAATAGTACT ATTTTGTGTTCATTTATTAAGGCAGCCTTGTCTTGTTTATACTTGACAAACTTTTCTTCCACTAAATTT TACTATTCTTGAGTAATAAATAAAAATAATTACTATATGATAGAATTTTCGTAAAAGAAACTATTCGAC CTTTTTCGTAAAATACGAAAATATTGATGTAGTAACTGGTGAAGGTACAGGCAAAGTCAAAAATGTCAA ACGAGTTAACTTTATTTAATTACTAGTAGTACTTTAATTAAATTAAACTATAGAATTAAAAAAGAAGAA GTTAGTATTAGAGTTTAATTCAATATTGCGGCTTTGTGGGATAGTTCAAATTCTTCATCCTTCACTCAC AATCACATGCCACTTTTTTTTTTCTTTAAAATTGTCACAATTTTTCTTCAACCTATCTCTTTCTATATA TCTATAAAAAGCCCCACCACCTTCTCTCGTTAGTAATCCAAACATACATCTTTCTTCTCAACTTTCTCT TTCTCTCAAAAACACCTTTTATTCTCTCTTTAGTTTCATCTATCCATCAATATACTTTTATTTCCATCA TCAATCAATTAGTTTCTTCGATCGATTCGAGTTAAATCATTATTCTTGATGGATCATCAACATGTTAAA GTTAATTTGAGCCGTGGAGATGCCAATAATAAGAATGAAGATGACATGGACCTCCGACGAGGTCCATGG ACCGTTGAGGAAGACTTGACCCTCATGAATTATATTGCTCATCATGGTGAAGGTCGTTGGAATACTCTT GCTCGTTGTGCTGGTAATTCATTTTATACT
Alternatively, load a local file with sequence in Fasta format: Local file name:
[Help] [Program's page]
Your use of Softberry programs signifies that you accept Terms of Use
Last modification date: 26 Oct 2016