Summary of Species and Promoter Classification

 

Species

Taxon

TATA promoters

TATA-less promoters

TOTAL

Actinidia deliciosa

Dicot

1

-

1

Aegilops tauschii

Monocot

-

1

1

Antirrhinum majus

Dicot

2

1

3

Arabidopsis thaliana

Dicot

52

57

109

Atropa belladonna

Dicot

1

-

1

Avena fatua

Monocot

2

-

2

Avena sativa

Monocot

2

-

2

Bertholletia excelsa

Dicot

1

-

1

Beta vulgaris

Dicot

1

2

3

Betula pendula

Dicot

1

2

3

Brassica juncea

Dicot

1

-

1

Brassica napus

Dicot

6

2

8

Canavalia gladiata

Dicot

1

-

1

Capsicum annuum

Dicot

2

-

2

Catharanthus roseus

Dicot

3

2

5

Chlamydomonas reinhardtii

Chlorophyta

2

8

10

Chlorella vulgaris

Chlorophyta

-

1

1

Chlorococcum littorale

Chlorophyta

-

1

1

Citrus sinensis

Dicot

-

1

1

Craterostigma plantagineum

Dicot

2

4

6

Cucumis sativus

Dicot

3

-

3

Daucus carota

Dicot

3

-

3

Dendrobium grex Madame Thong-IN

Monocot

-

3

3

Dianthus caryophyllus

Dicot

2

1

3

Dunaliella tertiolecta

Green algae

-

2

2

Eucalyptus gunnii

Dicot

2

-

2

Flaveria brownie

Dicot

1

-

1

Flaveria trinervia

Dicot

1

-

1

Glycine max

Dicot

21

10

31

Gossypium hirsutum

Dicot

6

-

7

Helianthus annuus

Dicot

7

1

8

Hevea brasiliensis

Dicot

1

-

1

Hordeum vulgare

Monocot

19

13

32

Ipomoea batatas

Dicot

2

-

2

Ipomoea nil

Dicot

-

1

2

Linum usitatissimum

Dicot

1

-

1

Lophopyrum elongatum

Monocot

-

1

1

Lotus japonicus

Dicot

2

-

2

Lupinus luteus

Dicot

2

-

2

Lycopersicon esculentum

Dicot

17

8

25

Lycopersicon penellii

Dicot

1

-

1

Lycopersicon peruvianum

Dicot

1

-

1

Lycopersicon pimpinellifolium

Dicot

1

-

1

Madagascar periwinkle

Dicot

1

-

1

Malus domestica

Dicot

3

-

3

Medicago sativa

Dicot

2

1

3

Medicago truncatula

Dicot

1

-

1

Musa x paradisiaca

Monocot

-

1

1

Nicotiana benthamiana

Dicot

1

-

1

Nicotiana glutinosa

Dicot

2

-

2

Nicotiana plumbaginifolia

Dicot

4

2

6

Nicotiana sylvestris

Dicot

7

2

9

Nicotiana tabacum

Dicot

21

10

31

Oryza sativa

Monocot

30

22

52

Papaver somniferum

Dicot

3

-

3

Petroselinum crispum

Dicot

3

5

8

Petunia hybrida

Dicot

6

2

8

Petunia integrifolia

Dicot

1

-

1

Pharbitis nil

Dicot

1

-

1

Phaseolus coccineus

Dicot

1

-

1

Phaseolus vulgaris

Dicot

9

3

12

Pinus sylvestris

Conifers

1

1

2

Pinus thunbergii

Conifers

1

-

1

Pisum sativum

Dicot

20

11

31

Populus balsamifera subsp. trichocarpa

Dicot

-

1

1

Populus kitakamiensis

Dicot

-

2

2

Prunus persica

Dicot

1

-

1

Pseudotsuga menziesii

Conifers

1

-

1

Psophocarpus tetragonolobus

Dicot

1

-

1

Pyrenomonas salina

Cryptophyta

-

1

1

Pyrus serotina

Dicot

1

-

1

Ricinus communis

Dicot

1

1

2

Sauromatum guttatum

Monocot

1

-

1

Scenedesmus obliquus

Chlorophyta

-

2

2

Sesamum indicum

Dicot

1

-

 

Sesbania rostrata

Dicot

1

-

1

Sinapis alba

Dicot

1

-

1

Solanum commersonii

Dicot

1

1

2

Solanum melongena

Dicot

2

-

2

Solanum tuberosum

Dicot

9

5

14

Spinacia oleracea

Dicot

-

7

7

Striga hermonthica

Dicot

-

1

1

Triticum aestivum

Monocot

14

5

19

Vicia faba

Dicot

2

1

3

Vigna radiate

Dicot

1

-

1

Volvox carteri

Chlorophyta

-

2

2

Zea mays

Monocot

16

20

36