Search for human potential splice sites using weight matrices
Paste nucleotide sequence here: >>Adh_and_cact.1 (2919020 bases) 848501 853000 ggatgctggtgcagacgccgggcatatcgaagtcctggatgagctcgatctgtctccggg agtccacttttttcatgagctgtgaccgctttcgccgatccgtcagccactgtgaaggag atactcatgagttaactgcttggcaacgggtttatcttgctactcacatctggcaccgac ttgccggcgctcaggttgtagatcttcacatcgttaacttcgtttacgaacatcttgagg gacgatttttgctcaaaattaaaacataaacaaacgaagtccgcaacacgtgcgccctct atcgatagacacgattgtcgatagcatctggctgcgataagcacctatcgcggcagtgtg acccttggcttgccaattgctcagtgtgaccgcaggaaaccaagcaaaacaagagaacgc aaaagcagtgaaaaaagactactgatttgcatcgacctaccaattgaaaataatcgcaat aattgcctctcggtgcagccccgcaaccccgcgaagccagtgtgcgtgctagcacgaaag tgaactgcattttgcatcgccaaattgcccaaaaattgcaatcgaattccgcacagccaa acaacaatacgcacacatacacacagtaccccccgctctgcgtaaccgccctacgttaca cattccgttcgctccctaaggtggactaaaactaaagtgatctaaaacggtgagtaatat tcgttgtttttccttaagccaattaaacactgattaaattatgcgaaatggaaaaccgtc tgcgaaggggtgacgcagtgcagctgtgggtgctccgcaactttcccttgtgctctcgct ctctcttgtttttgtcgttaggcagcagcactccattgttgttgtatacaccccctgatt gctttgataccctgcaatggggagttactgttttgtgaccaagttaagaaaataaatatg atttacaaaaatcgattaattctggggatgtttcaggtttttatggtgtataatttattt tttgaatttttaggggatggtggggcaaaaacggccgccactctacttaaaaatcggtag gtgaggagtttgtttagtatacgctataaataaatactctaaattagtttttataagatg gattattatatgagtgtatgagttatcatagaaatatttacctgtgcttatatattaatt tattatatgaattatgcaaacaaggttttttcaaaatgtaggcgagcatgaataaaaaat tataataaatcagaagttttcttagtagttgttatcagttattaatatatttctttttca ttttgttgtgtcttattgcgttgttgtcttcaatgcgggcttattttattagtttgaatg gatgtgcgcttatttgtagatactcaaatatcaaatcgtattcagttatatcttagaaat ggaatataaagcgcacatttataaaagtatatttatatttaagattttttgccaaagggt atacatacttcgtctgtgtataaatatatatttctcatactcctttcgttattttccctg ttatgggtgcgccgctgtgttccttttatgaggggcaatgatgatccacttccattcaac acattttgcaaataagtacatatgtacttcgcctccattgattgctccactgatgtttgg cctttggcgcttgactgataagactcgagaccgagacctactacttagttagtctaaact gcccgtcatagagcctattaaactgatatgcacttgtcactttgacaagcaatgataagc gattataactgtatttgatgatttaagtatgagcaattaagaatccataattgatactca tcttttcacactatatgctgctaagtcacattcttttgtatgaaattcattcatatgaag taaggcaggatgattaccctaaatacaaactaacttgatgaataacttcgcgcgtactgc tcttaataattgaattcccacgattgcttgctcggcgaccttgatccaaatcgctttcag cttgggcgaagggttcaattcactctcttcagcgccccttaactgcggacaaatcaaagg ctttcgaacgacacggatactgcgaatggacaaagtcaagtggcatgaagtggatatacc cgccgctcttgaagcttgcctctttcttatttttttttttttttggcttcagttggcagg caaacaaacccggtcggctgttcaaacacaagcaggccttaaaaagaaatatcggggcca gttcgagaaaggggaacaaaatgtggtgtcgacgcagaacaaattaatgcagcgcctcgg tttgttgataagcagcgactacggttggacattcaaatgaggagctgatagtagtagtta acactgtttgattgggtcagagttcatttctgccggtgtcaagatgagcaaagtgcgcag cgtggtgaacaaactgcacgaacgcatagactactttattgaaaaatgtgtgaaatattc tatatactcaatgactctgcaatgtaataataataataatttcgcttgctttttaggtcc caacatgactgcagcgccatacaactacaactatatctttaaatacatcatcattggtga catgggcgtgggcaagtcctgcctgctccaccagttcaccgagaagaaatgtgagtagac tgtgctgagtaataatgtatgtaataagaactaatctctacttgccgtcctgcagtcatg gccaattgtcctcacaccattggcgtggagttcggcacacgcatcattgaggtggacgac aaaaagatcaagctacagatctgggacacagcgggtcaggagcgattcagggcagtgaca cgctcctattaccgtggagcagctggtgcgctgatggtctacgatattaccaggcggtaa gcgaagcaagctactatttgagaaattgctttacaacttgaccattccagctccacgtac aatcacctgagcagctggcttaccgacactcgcaatctcaccaatcccagcactgtgatc tttctcattggcaacaaatcggatctggagagcactcgggaggttacctacgaggaggcc aaggagtttgccgacgagaacggcctaatgtttctcgaagcgagcgctatgacgtgagtt tcaactggaagcatagtgtttgagcatatactgattatctttttttttatcgcccaaaca gtggccagaatgtggaggaggcttttctggagaccgcacgcaagatttaccagaacatcc aggagggtcggctcgatctgaacgcctccgagtccggagttcagcacaggccatcgcagc cgtcgcgaacttcgctgagtagcgaggctacgggcgccaaggatcagtgctcgtgctaaa tgaatgatggaacctaactttacgcaaaacctagttatacaaatcaacttttatttttag ccgactcgtaatctaccgatgcccaagcaaaaaccaatgtatgtagttaaataattcgat taagcatcaatgtgtgagccaacaacagcgacagcaaccacaaaaaaaaaaaaaaacaga aaaagaaaatataaagtcctttcgcttaataagacgcaagcattgcaacatttattgtat cggttaagcataaatactagaaaattaaacatgtttgttggcgcaaactaaagttttgac catgaaatttcgaaaagtttatcgcactaacaccatccttcggtctcaatttatagatga attcgtttgagatatagatcatgtttttgttggctgatgaatccctgtatataatatata tatgtatgaatttttgtatctccctaattttttgttgagtatttgttgttgtcgcgtgca agaattggaggaaacgatcaatgttatatgaatatttacgatgtattaatggcataatgc aataggaaataaataaaatggtatttataaaacccctaccaatagaaatgaatttctctt tcaaataatttaaattttaatttgcatatttaaccattcgtttatatttaattctacacc aaatcgctggataattttataatttaccggatttccatttaatagatttaaattttataa atatttgggtacttacgatttacttaaatattttgtaaaaagcttttttaatccatttag tggaataccctcaactttgacttgcgcataacttcattcttgttttatttagtgatgcta acgttgggttggaaatcagctgattatgactatgaacaataaagtttgtaagtcaaacaa cgatttttcgtatactgttcttttgtttgttgctggttgtctaattaatcattttaactg gttatcagtccaatttttgttttctacactacactattctacactattttcgatttcctt gaaatttagcgggaaaaactctgagctagcatcttcggtggcatcgctgtgtgcgcgctt
Alternatively, load a local file with sequence in Fasta format: Local file name:
[Help] [Show advanced options] [Program's page]
Return to page with other programs of group: Gene finding
Your use of Softberry programs signifies that you accept Terms of Use
Last modification date: 24 Jul 2007